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通過NGS或者質(zhì)譜平臺拿到序列后，面臨的一個重要問題就是：選擇什么數(shù)據(jù)庫進行比對才能得到較好的分類鑒定結(jié)果呢？數(shù)據(jù)庫中圖譜的質(zhì)量、數(shù)量都將直接影響鑒定的成功率與準確率。如原核的16S rDNA序列，真核的18S rDNA序列、ITS（ribosomalinternal transcribed spacer）序列等。    有兩個關于人體微生物組的奠基性研究，一個是人類腸道宏基因組計劃 MetaHIT，由歐盟發(fā)起，8個國家14個研究機構(gòu)參與。華大基因承擔了其中關鍵的測序與分析工作，從2008年1月1日到2012年6月30日，構(gòu)建了第一個腸道微生物基因集，包含330萬個基因，氮吹儀是近年來腸道微生物研究的里程碑。另一個是由美國國家衛(wèi)生院發(fā)起的人類微生物組計劃。從2008年到2013年，采集了人體各個部位共超過5000份樣本進行了測序和深入的分析，繪制了人體相關的微生物圖譜，并破解了3000種微生物前基因組，初步建立了人體共生微生物參考數(shù)據(jù)庫。    其實針對每一類生物的主要marker序列都有相應的數(shù)據(jù)庫以方便比對鑒定。如 RDP數(shù)據(jù)庫（RibosomalDatabase Project）、SILVA數(shù)據(jù)庫（一個包含細菌、古菌、真核rRNA基因序列的綜合數(shù)據(jù)庫）、Greengenes（針對細菌、古菌16S rRNA基因）數(shù)據(jù)庫、 PR2（ProtistRibosomal Referencedatabase）數(shù)據(jù)庫（針對真核微生物18SrRNA基因）等等。 目前國內(nèi)僅梅里埃和BD兩家外企，及北京毅新博創(chuàng)的微生物質(zhì)譜獲得CFDA認可。雖然外企大范圍市場推廣時間較短（約2-3年），市場總裝機量不超過400臺，但是根據(jù)2016年檢驗醫(yī)學網(wǎng)的數(shù)據(jù)，2015年在細菌鑒定和藥敏檢測中，梅里埃的質(zhì)譜儀已達到了2%的市占率，增長迅速氮吹儀�？傮w來看占據(jù)主導地位的還是梅里埃和西門子的傳統(tǒng)檢測系統(tǒng)，目前合并統(tǒng)計后生物梅里埃在細菌鑒定和藥敏檢測中市占率高達61.1%，西門子緊隨其后為26.7%。    質(zhì)譜技術在臨床微生物菌種鑒定領域的應用，除了技術本身，更重要的是依賴于質(zhì)譜菌種鑒定數(shù)據(jù)庫。因此，數(shù)據(jù)庫中圖譜的質(zhì)量、數(shù)量都將直接影響鑒定的成功率與準確率。由于病原微生物分布流行情況不同，實驗室在原有數(shù)據(jù)庫基礎上可補充建立本地病原微生物的質(zhì)譜指紋圖譜庫，提高鑒定成功率。    目前梅里埃和BD的產(chǎn)品均可以鑒定2000多種微生物，安圖生物在微生物檢測領域積累20多年，已開發(fā)出具有自主知識產(chǎn)權(quán)的中國本土化微生物菌株數(shù)據(jù)庫，可鑒定超過1500種微生物。    反觀NGS在微生物領域額應用，目前全球還沒有相關領域的注冊試劑獲批。國外是通過LDT的方式開展。國內(nèi)目前處在方法學的標準品驗證階段。由中檢院負責，華大基因、博奧生物、達瑞生物和賽哲生物四家公司是第一批參與標準品驗證的行業(yè)玩家。其中華大基因用自己的BGISEQ測序平臺，博奧生物、達瑞生物兩家用Thermo Fisher的NGS平臺，賽哲生物用的是Illumina平臺。    所謂標準品是行業(yè)對NGS方法學，即測序平臺的驗證。由中檢院“出題”，構(gòu)建一個由1000多種基因組成的樣品“黑箱”，四家受試者在各自的平臺上分析。檢測準確度達到一定標準的，就把這種檢測平臺作為方法學的標準品，后續(xù)可以在這個平臺上開發(fā)產(chǎn)品。毫無疑問，通過率先通過標準品驗證的公司會在行業(yè)建立先發(fā)優(yōu)勢。    由于病原微生物分布流行情況不同，這些公開數(shù)據(jù)庫不能完全滿足臨床檢測需求。實驗室在原有數(shù)據(jù)庫基礎上需補充建立本地病原微生物的質(zhì)譜指紋圖譜庫，提高鑒定成功率。    2016年初，之江生物（834839.OC）發(fā)布公告稱出資 50 億韓元，約合 2,750 萬元人民幣，認購韓國 ChunLab公司390,625 股新增股份,增資后之江生物持有后者 12.93%的股權(quán)。ChunLab公司擁有一個龐大的、非公開的微生物數(shù)據(jù)庫。我們預測之江生物的這個布局意味著即將會在微生物檢測領域有所作為，也為未來業(yè)績增長創(chuàng)造了很好的先發(fā)優(yōu)勢。